Шта су пептиди који продиру у ћелије?

Пептиди који продиру у ћелију су мали пептиди који лако могу продрети у ћелијску мембрану.Ова класа молекула, посебно ЦПП са функцијама циљања, обећава ефикасну испоруку лека циљним ћелијама.

Стога истраживања о томе имају одређени биомедицински значај.У овој студији, ЦПП са различитим трансмембранским активностима проучавани су на нивоу секвенце, покушавајући да открију факторе који утичу на трансмембранску активност ЦПП, разлике у секвенцама између ЦПП са различитим активностима и НонЦПП, и уведу метод за анализу биолошких секвенци.

ЦПП и НонЦПП секвенце су добијене из базе података ЦППсите и различите литературе, а трансмембрански пептиди (ХЦПП, МЦПП, ЛЦПП) са високом, средњом и ниском трансмембранском активношћу екстраховани су из ЦПП секвенци да би се конструисали скупови података.На основу ових скупова података, спроведене су следеће студије:

1, Састав аминокиселина и секундарне структуре различитих активних ЦПП и НонЦПП анализирани су АНОВА-ом.Утврђено је да електростатичке и хидрофобне интеракције аминокиселина играју важну улогу у трансмембранској активности ЦПП, а спирална структура и насумично намотавање такође утичу на трансмембранску активност ЦПП.

2. На дводимензионалној равни су приказане физичке и хемијске особине и дужине ЦПП са различитим активностима.Утврђено је да се ЦПП и НонЦППс са различитим активностима могу групирати под неким посебним својствима, а ХЦПП, МЦППс, ЛЦППс и НонЦППс су подељени у три кластера, показујући њихове разлике;

3. У овом раду се уводи појам физичко-хемијског центра биолошке секвенце, а остаци који чине секвенцу посматрају се као тачке честица, а секвенца се апстрахује као систем честица за истраживање.Ова метода је примењена на анализу ЦПП-ова пројектовањем ЦПП-ова са различитим активностима на 3Д раван ПЦА методом, и установљено је да се већина ЦПП-ова групирала заједно, а неки ЛЦПП-ови груписали заједно са НонЦПП-овима.

Ова студија има импликације на дизајн ЦПП-а и разумевање разлика у секвенцама ЦПП-а са различитим активностима.Поред тога, метода анализе физичко-хемијског центра биолошких секвенци уведена у овом раду може се користити и за анализу других биолошких проблема.У исто време, они се могу користити као улазни параметри за неке проблеме биолошке класификације и играју улогу у препознавању образаца.