Ови антимикробни пептиди су првобитно изведени из одбрамбених система инсеката, сисара, водоземаца, итд., и углавном укључују четири категорије:
1. цекропин је првобитно био присутан у имуној лимфи Цецропиамота, који се углавном налази у другим инсектима, а слични бактерицидни пептиди се налазе и у цревима свиња.Обично их карактерише јако алкални Н-терминални регион праћен дугим хидрофобним фрагментом.
2. Ксенопус антимикробни пептиди (магаинин) се добијају из мишића и стомака жаба.Утврђено је да је структура антимикробних пептида ксенопуса спирална, посебно у хидрофобним срединама.Конфигурација ксенопус антипептида у липидним слојевима проучавана је НМР-ом у чврстој фази.На основу хемијског померања ациламинске резонанце, спирале ксенопус антипептида биле су паралелне двослојне површине и могле су да конвергирају да формирају кавез од 13 мм са периодичном спиралном структуром од 30 мм.
3. дефензин Одбрамбени пептиди су изведени из хуманих поликариотских неутрофилних полимакрофага зеца са комплетним нуклеарним лобулом и цревним ћелијама животиња.Група антимикробних пептида сличних одбрамбеним пептидима сисара екстрахована је из инсеката, названих „пептиди за одбрану од инсеката“.За разлику од одбрамбених пептида сисара, пептиди за одбрану од инсеката су активни само против грам-позитивних бактерија.Чак и пептиди за одбрану од инсеката садрже шест Цис остатака, али је начин међусобног везивања дисулфида другачији.Начин везивања интрамолекуларног дисулфидног моста антибактеријских пептида екстрахованих из Дросопхила меланогаст био је сличан оном код одбрамбених пептида биљака.У кристалним условима, одбрамбени пептиди су представљени као димери.
4. Тахиплесин се добија од потковица, званих потковица.Студије конфигурације показују да усваја антипаралелну Б-преклопну конфигурацију (3-8 позиција, 11-16 позиција), у којојβ-угао је спојен један са другим (8-11 позиција), а генеришу се две дисулфидне везе између положаја 7 и 12, и између положаја 3 и 16.У овој структури, хидрофобна амино киселина се налази на једној страни равни, а шест катјонских остатака се појављују на репу молекула, тако да је структура такође биофилна.
Из тога следи да су скоро сви антимикробни пептиди катјонске природе, иако се разликују по дужини и висини;На високом крају, било у облику алфа-хеликалног илиβ-склопива, битропска структура је заједничка карактеристика.
Време поста: 20. април 2023